公共工作流

GeneDock 为了解决全基因组级别的数据处理矛盾(测序数据的分析增长大于IT资源的供给),帮助基因领域从业者能够多、快、好、省的完成人全基因组数据分析。

GeneDock 云平台 基于万级别的WGS任务分析经验,通过机器学习对每一步骤进行了优化,高效利用云端资源,调动足够的任务通量可应对万级别的WGS分析需求。在任务调度层,GeneDock 自主开发的的分布式调度引擎,提供稳定的计算和数据架构,保证任务的稳定性。在生信分析算法层,使用在precisionFDA挑战赛的多个项目上夺冠的Sentieon,大幅度加速了WGS的分析速度。GeneDock提供了图形化、命令行和自动化方案,用户可根据具体业务场景选择合适的解决方案。

GeneDock HG 全基因组标准分析服务,是第一次对外发布的一款低于100元的WGS分析产品,在保证一致性的情况下,时间缩短为原来的几倍。

VEP由国际三大数据库之一的Ensembl提供,基于perl语言。VEP可用于变异分析、注释和对编码、非编码区域的基因变异进行排序。本工作流使用VEP91对变异进行注释,标记变异对基因、转录组、蛋白序列和调控的影响。支持hg19/b37坐标。

本章节主要展示 HG 的4种工作流及其高级分析的VEP工作流。