GeneDock(聚道科技)于2017年3月6日正式发布基于云计算的人全基因组标准化分析服务——GeneDock HG。它是一项面向人全基因组大规模分析的服务,主要完成从fastq到vcf的标准化分析,其成本、速度、稳定性和结果准确度均达到了大规模生产服务的标准。GeneDock HG对30X人全基因组数据的分析价格为99元/次,这也是业内首次实现了百元以下的人全基因组标准化分析服务。
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GeneDock(聚道科技)于2017年3月6日正式发布基于云计算的人全基因组标准化分析服务——GeneDock HG。它是一项面向人全基因组大规模分析的服务,主要完成从fastq到vcf的标准化分析,其成本、速度、稳定性和结果准确度均达到了大规模生产服务的标准。GeneDock HG对30X人全基因组数据的分析价格为99元/次,这也是业内首次实现了百元以下的人全基因组标准化分析服务。
本文总结了生物信息人员在使用BLASTX的一些经验,期待与其他同行交流BLASTX的优化经验。
BLAST作为生物信息最重要的局部比对工具,在序列物种注释和基因注释起重要作用。其中BLASTX(将query序列翻译成氨基酸序列和蛋白数据库进行比对)常常作为对核酸序列的基因注释工具。BLASTX先要将DNA序列按照6个读码框翻译成氨基酸序列,从而BLASTX的比对时间和需要计算资源都是比较大的,如何减少运行时间和降低运算成本,成为生信工作人员关心的重要问题之一。另外,本文主要讨论BLASTX工具的优化,其他BLASTX的替代工具,比如DIAMOND等,不在此文的讨论范围。
阅读文章>>从公司回来,到明天的毕业图像采集,差不多满满一个月了。
8月16日,CEO李厦戎受邀参加了联想之星Comet Labs的线上微课分享,主题为《DNA遇上云计算:前阿里、前华大的他们为何投身基因数据云服务领域》,以下为分享内容:
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2016云栖大会北京峰会以“DT NEXT”为主题,讨论云计算与大数据技术的应用,跨越国界和技术边界,与DT世界的未来对话。
在专门针对开发者、架构师、以及产品技术管理人员的“Tech Insight” 实战专场上,阿里云和细分领域的顶级技术专家们分享了云计算的前沿技术,包括大数据、存储、数据库、网络安全、视频服务、以及各类垂直行业解决方案等。
2016年7月24日,“第二届精准医疗与基因测序大会”在北京协和学术会堂成功举办。此次大会由北京协和医院肝脏外科和测序中国主办,中国医学科学院基础医学研究所协办。会议嘉宾汇集了精准医疗与基因测序领域的数十位权威专家,并针对精准医学在疾病及基因大数据分析等领域的研究进展进行了精彩的报告。
聚道科技(GeneDock)受邀参加了本届精准医疗与基因测序大会,我们的Boss李——CEO李厦戎在下午的分会场中进行了题为《面向精准医学的组学数据管理实践》的报告,分享了我们为组学数据管理提供的技术及解决方案。