2016-04-15GeneDock

云联盟来了

2016年4月11日,华大基因、阿里云、百度开放云、华为、GeneDock、WeGene在基因组云计算技术开发者大会(GCTA)中共同发起成立了“中国生物信息云计算产业联盟”(以下简称云联盟),并且得到了包括百迈客、艾吉泰康、华开科技、奇云诺德、基云惠康、裕策生物等公司的积极响应。这是国内首个生物信息领域产业联盟,也是生物技术公司与信息技术公司展开的最大规模的产业合作。云联盟将对BT+IT行业带来怎样的影响,我们不妨一同解读一二。




数据
从最开始的人类基因组计划,到75家公司与组织合作的千人基因组计划,直至如今英国政府牵头推进的10万人基因组计划,生物信息行业处理的数据量从GB级增长到PB乃至EB级别。

  • 目前已测序物种约7万4千余种,可能只占到我们想测序的所有数据的0.1%,所有物种的0.85%【1】

  • 随着基因组学研究的不断深入,其成果正逐渐应用于临床诊断、药物研发、健康管理等关键领域,组学数据爆炸的时代离我们并不遥远。如此量级的数据,已经超出了任何单独的公司或机构的能力所及,这也要求行业内进行更大规模的分工协作。从云联盟主要发起者的展示中可以看出,行业领先的公司都非常期待基因组数据的快速增长,也希望通过联盟的形式为这一趋势做好准备。

  • 英国已宣布进行涉及10万人全基因组的精准医疗项目,美国的相关项目更涉及近100万人。要实现精准医疗,中国参与全基因组计划的人口预计将超过500万【2】

  • 技术
    对于海量基因数据的分析需求,传统的生信分析流程和方法很难保证高效稳定,借鉴IT行业已经累积多年的大数据分析经验势在必行。阿里云、百度开放云、华为都有着多年的云计算硬件积累和服务经验,可以帮助生物信息行业摆脱硬件更新、运维的烦恼。而GeneDock、BGIOnline则基于各自在基因组云分析领域的Best Practice,可以在云端基础架构之上提供更满足生信行业需求的基因云服务,解决基因组学数据在传输、存储、分析等环节面临的安全和效率问题。此外,联盟内部还会进行充分的技术交流和学习,推动新技术在生信领域的应用。这种BT+IT的技术融合将会帮助基因检测行业更快的实现产业模式的优化和转变。


    合作模式
    过去,考虑到基因组数据的敏感性和长效性,行业内企业之间的合作并不充分,生信数据和方法缺乏充分的沟通交流,行业的快速发展也因此受到了限制。


    云联盟作为偏向产业合作的行业联盟,汇集了IT巨头和生信新军,为大家创造彼此借鉴和相互探讨的机会。云联盟近期计划制定组学研究的数据标准和格式规范,也是学习了IT行业过去的发展经验,通过集中行业资源实现技术和商业上的快速突破。而在会议中,云联盟各发起方也反复强调了保持开放心态的重要性,欢迎其他企业共同参与体系构建,从而实现这个联盟成立的初衷:驱动产业进步,实打实地创造价值、创造利润,通过技术促进基因组学发展,回馈和造福社会



    作为“中国生物信息云计算产业联盟”的发起方,GeneDock已经成功地为生信行业提供了领先的企业级生物信息云服务,支持不同领域的众多客户从事精准医疗、传染病预防控制、分子育种等工作。生物信息云计算模式是行业公认的发展方向,需要行业间和行业内进行更充分的协作。GeneDock将和”云联盟”的其他成员一起,通过成立行业协会、设立生信技术奖项等活动,推动“政、产、学、研、资、媒”六位一体合作。可以预见,“云联盟”将会吸引更多的企业和机构,集众家所长,共同推进挖掘利用海量组学数据的产业协作。


    参考资料:
    【1】Genomes Online Database
    【2】英国的10万人基因组计划,最近进展如何?